Sfarbenie srsti divých koní vždy zodpovedalo prostrediu, v ktorom žili. Sfarbenie im poskytovalo možnosť dokonale splynúť s okolím, a tak sa chrániť pred nepriateľmi. Ako príklad môžeme uviesť púštne, pieskovohnedé sfarbenie koňa Przevalského. Väčšina súčasných farebných variantov vznikla až zámerným krížením. Podobne ako iné dedičné znaky, aj niektoré farby srsti koní majú dominantnú funkciu. To znamená, že žriebätá sú sfarbené vždy po rodičoch s dominujúcimi génmi určujúcimi farbu srsti.Iné sfarbenia sú naopak recesívne. Prejavujú sa iba v prípade, keď má sfarbenie oboch rodičov recesívny charakter. Poradie dominantných farieb je nasledujúce: sivá, gaštanová, hnedá a čierna. Čěrvenohnedé sfarbenie je dokázateľne recesívne.